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由卡罗林斯卡学院的 Camilla Björkegren、东京大学的 Kristian Jeppsson 和 Katsuhiko Shirahige 领导的 UTokyo-KI LINK 项目的一项合作研究表明,一种名为 Smc5/6 的蛋白质复合物与称为正超螺旋的 DNA 结构结合。当染色体 DNA 双螺旋由于转录引起的过度扭曲而自我折叠时,就会形成这些结构,这是基因表达的第一步。
该研究提供的体内数据表明,Smc5/6 与含有高水平转录诱导的正超螺旋的区域中的染色体环碱基结合。该复合物还被证明可以控制这些区域的三维(3D)组织。
计算机器学习提供了额外的结果,支持转录诱导的正超螺旋决定 Smc5/6 的染色体结合模式。最后,法兰克福马克斯·普朗克研究所的 Eugene Kim 博士团队进行的体外单分子分析提供了 Smc5/6 优先结合阳性 DNA 超螺旋的直接证据。
综上所述,分析表明基因表达通过改变DNA螺旋的结构来影响染色体的空间排列,从而触发Smc5/6的关联。该研究发表在《分子细胞》杂志上。
由于染色体的 3D 组织影响细胞功能和存活,因此这些发现对于我们对生命的基本理解非常重要。有趣的是,染色体的 3D 组织也可以控制基因表达,这表明这两个过程之间存在由正超螺旋和 Smc5/6 介导的动态反馈环。此外,由于 Smc5/6 抑制多种病毒的复制,并且该复合物的突变版本与发育缺陷和肿瘤形成有关,因此获得的知识在医学角度也具有相关性。
Björkegren 说:“我们现在的目标是进一步研究我们的新发现的功能后果,特别是它们与 Smc5/6 在病毒保护、发育和肿瘤预防中的作用之间的关系。”
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