科学家们广泛研究了遗传物质的结构和序列及其与蛋白质的相互作用，希望了解我们的遗传学和环境如何与疾病相互作用。这项研究的部分重点是“表观遗传标记”，即对 DNA、RNA 和相关蛋白质(称为组蛋白)的化学修饰。

表观遗传标记影响基因何时以及如何开启或关闭。它们还可以指导细胞如何解释和使用遗传信息，影响各种细胞过程。因此，表观遗传标记的变化会显着影响基因调控和细胞功能，这意味着它们可能会导致疾病。通过研究表观遗传标记，研究人员可以阐明它们在健康和疾病中的作用，并有可能发现新的治疗途径。

虽然研究人员可以识别和比较表观遗传标记，但理解特定修饰与基因工作方式之间的相关性仍然具有挑战性。为了帮助克服这个问题，Dan Ohtan Wang 博士和 Kandarp Joshi 博士创建了一种名为 epidecodeR 的新工具。这个用户友好的工具发表在《生物信息学简报》上，使生物学家能够快速检查修饰是否会影响基因在特定情况下的反应。

“如果发现正相关，这可能会激励科学家证实这些发现，帮助他们了解这些基因修饰在各种条件下的作用，包括癌症和神经系统疾病，”集成细胞材料研究所的研究员乔希解释道科学(iCeMS)。

研究小组使用统计方法根据基因的修饰数量对基因组进行分类。他们表明 EpidecodeR 可以预测特定修饰的作用，例如改变某些蛋白质或使用药物，以及这些修饰如何影响基因活性。

领导这项研究的 iCeMS 客座教授 Wang 表示：“我们使用 epidecodeR 成功预测了一种名为组蛋白脱乙酰酶的蛋白质如何影响基因活性。” “我们还发现 epidecodeR 能够有效识别能够阻断另一种蛋白质(称为 RNA 去甲基酶)的物质，并且我们探索了称为组蛋白的蛋白质的变化如何与药物滥用相关。”

研究人员计划进行进一步的研究，以提高 epidecodeR 的准确性和特异性。乔希说：“我们希望提供更多有关基因修饰在何处、如何发生以及有多少修饰的细节。” “随着数据变得更加复杂，我们还旨在为用户提供各种统计测试，以增强工具的功能。”

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