由于密歇根州是全国领先的酸樱桃产地，密歇根州立大学的研究人员正在寻找与该季节晚些时候开花的酸樱桃树相关的基因，以满足不断变化的气候需求。他们首先将晚开花的酸樱桃树的DNA序列与相关物种桃子的基因组序列进行比较。然而，令研究人员惊讶的是，物种之间的遗传差异超过了相似性。这促使该团队创建了第一个带注释的蒙莫朗西酸樱桃基因组，并确定了为每个基因编码的DNA片段。

该研究发表在园艺研究杂志上。

“我天真地认为这将是一项简单的尝试;我们只需对一些早开花和晚开花的樱桃树进行测序，并将序列与桃子基因组进行比对，然后在短短几周内得到答案，”助理考特尼·霍伦德(CourtneyHollender)说。MSU农业与自然资源学院教授。“我大错特错了。”

基因组包含生物体发育的所有基因和遗传指令。对它进行测序为研究人员提供了一张地图，例如，当他们试图种植一棵将在本季晚些时候开花的樱桃树时。对于Hollender的博士生CharityGoeckeritz来说，挫败感激发了她的好奇心。

“我试图将酸樱桃的DNA序列与桃子的基因组进行比对，但它们并没有很好地比对，”Goeckeritz说。“我向所有人抱怨这件事，最后，我的一位朋友建议我们只对酸樱桃基因组进行测序。”

Hollender和Goeckeritz与密歇根州立大学名誉教授AmyIezzoni以及美国唯一的酸樱桃育种者合作;Iezzoni的博士生KathleenRhoades;BobVanBuren，园艺系和密歇根州立大学植物恢复力研究所助理教授;MSUGenomicsCore主任KevinChilds;密歇根州立大学园艺系副教授PatrickEdger。他们一起发现蒙莫朗西酸樱桃基因组比他们原先想象的更复杂。

复杂性来自酸樱桃的亲本植物染色体。酸樱桃是异源四倍体，这意味着它们不像人类那样拥有两组染色体，而是拥有至少两个不同物种的四组染色体。

“酸樱桃不仅每条染色体有四个拷贝，而且还是两个不同物种自然杂交的产物，”Goeckeritz说，“地面樱桃Prunusfruticosa和甜樱桃Prunusavium，可能几乎发生在两百万年前。”

在Goeckeritz使用基因组研究开花时间的同时，为该项目进行RNA测序或基因表达分析的Rhoades正在努力识别与特定水果性状相关的基因，例如颜色和硬度。

拥有蒙莫朗西酸樱桃基因组序列为未来进行大量研究提供了可能性，这些研究最终将使行业和消费者受益，因为他们种植了更多能够承受春季多变天气的树木并生产更多樱桃。

“在这个基因组之前，有一些酸樱桃的序列，但它不是完整的图片，我只是想拥有用于研究和育种目的的基因组，”Hollender说。“现在我们有了一个完整的画面，这项研究将对全球所有未来的酸樱桃研究和育种工作产生重大影响。”

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