香港大学李嘉诚医学院(HKUMed)的研究团队开发了一种新方法，突破了目前大规模优化精确基因组编辑器的有限通量，并设计了数百个(或更多)碱基编辑器变体并行而不是通过当前费力的一次一次测试，并告知用户最适合治疗性基因组编辑的测试。该发现已发表在《CellSystems》上，并已根据这项工作提交了专利申请。

碱基编辑是一种较新的基于CRISPR的基因组编辑技术，通过将DNA中的单碱基突变(如镰状细胞病、家族性高胆固醇血症等)纠正为正常形式，成为治疗单碱基突变遗传性疾病的更安全的工具。。

然而，现有的碱基编辑可能会导致不同的结果，具体取决于所使用的碱基编辑器的类型和版本、目标DNA的序列组成以及要转换的DNA碱基的位置。选择次优的碱基编辑器进行应用可能会在目标DNA碱基周围产生不正确的编辑和额外的突变，这可能会导致不良影响。

目前，必须进行费力、详尽的一次测试来表征数十种可用碱基编辑器的编辑性能，以优化它们在每个治疗位点上的使用。此外，许多治疗基因座尚不具备用于精确编辑的现有优化碱基编辑器。尽管全世界都在努力，但使用传统方法创建新的碱基编辑器可能需要数月或数年的时间。

香港大学医学院的研究团队成功开发了一个将碱基编辑报告系统与CombiSEAL相结合的平台，CombiSEAL是一种先前开发的最先进的技术，可快速设计数百个(或更多)碱基编辑器变体，同时结合不同的酶促脱氨酶结构域和组合。基于CRISPR/Cas9的DNA识别域。这些变体的兼容性和性能尚未以面对面的方式进行表征和比较。

该团队应用该平台定量读出每个变体的编辑效率、纯度、序列基序偏好以及在人类细胞中生成单碱基和多碱基转换的偏差，这有助于通过生成特定类型的碱基转换来选择最合适的治疗靶点具有最高的效率和最少的不需要的编辑。

该团队扩展了该平台的使用，进一步提高了当前碱基编辑器系统的效率。团队成员进行了一次筛选，重点关注碱基编辑器系统中使用的sgRNA(单引导RNA)支架的茎环2区域，并成功鉴定了两种新型sgRNA支架变体SV48和SV240，其性能优于野生型。-型脚手架以实现更高(高达2.2倍)的碱基编辑效率。

此外，该团队证明该平台不仅可以用于碱基编辑器表征和筛选，而且还与其他精确基因组编辑系统(例如prime编辑器)兼容。这可以扩大寻找其他合适编辑器的范围，以纠正碱基编辑器不适用的治疗靶点的基因突变。

该平台在加速下一代精确基因组编辑器的工程以及这些编辑器在未来治疗用途中的适应方面具有强大的功能。

“这就像商店中的加速结账流程。由于所有产品项目(即基本编辑器变体)都标有条形码，因此当涉及结账柜台条形码扫描仪时，我们只需将所有商品批量放入购物篮中即可。黄绍伦博士说：“扫描仪可以自动识别所有商品并完成付款(即我们的案例中的碱基编辑性能分析)。无需对每个碱基编辑器进行单独测试。”港大医学院生物医学学院副教授解释。

该研究由港大医学院生物医学学院副教授黄少伦博士领导。方海进博士学生，为第一作者，并得到香港大学医学院生物医学学院博士后朱海仪博士和周鹏博士的协助。

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