在《中国科学生命科学》杂志上发表的一项研究中，陕西师范大学的俞佳宁研究小组和武汉大学的朱玉贤研究小组组装了一个大小为777.8 Mb 的榴莲参考基因组，该基因组有 28 条染色体和 38,728 个蛋白质编码基因。

高质量的榴莲基因组使作者能够从锦葵科植物共有的 11 条原染色体重建祖先核型，并重建形成其当前基因组结构的进化轨迹。通过比较基因组分析，作者发现榴莲在大约 2000 万(1700 万至 2400 万)年前经历了一次 WGT 事件。

作者进一步发现，扩展的全基因组扩增 (WG) 基因在苯丙烷途径的木质素生物合成模块中显著富集，这表明榴莲中最近的全基因组扩增 (WG) 可能促进了这一特定途径的多样化和专业化，这对于其特征性果刺的发育非常重要。

转录因子基因家族的扩展，以及特定热休克因子家族和几种热休克蛋白的显著上调，可能导致榴莲具有能够承受极端热条件的复杂而强健的系统。

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