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基因组数据改写了中国燕麦驯化的故事

开心的月饼 2023-08-01 08:50:04 健康养生

就全球产量而言,燕麦是十大谷类作物之一。它可以适应不同的气候,即使在水稻和玉米等其他作物无法生长的恶劣环境下,农民也能成功种植它。然而,并非所有燕麦植物都是一样的。根据其谷物,可以轻松区分两种主要燕麦品种:带壳燕麦,被不可食用的外壳覆盖的谷物;以及裸燕麦,其具有柔软的外壳,在脱粒过程中很容易与可食用谷物分离。

基因组数据改写了中国燕麦驯化的故事

为了获得有关这些不同品种起源的信息,中国研究人员对来自世界各地的100多种燕麦植物的基因组进行了测序。他们的分析表明,与目前的看法(这两个品种来自同一个驯化事件)不同,带壳燕麦和裸燕麦是独立驯化的。该工作发表在《GigaScience》杂志上。

据信,如今世界各地种植的普通燕麦(Avenasativa)大约3,000年前在欧洲被驯化。相比之下,如今主要在中国种植的莜麦的起源仍不清楚。许多研究人员将裸燕麦视为带壳燕麦的变种,推测带壳燕麦传入中国后发生了突变。然而,内蒙古农业大学(IMAU)韩冰教授实验室生成和分析的新群体基因组数据却讲述了不同的故事。

作者估计,带壳燕麦和裸燕麦在大约51,000年前就开始分化,而不是最近才分离出来的普通燕麦的变种。因此,他们推测这两个品种很久以前就被独立驯化了,而不是其中一个品种是另一个品种最近的衍生品。该研究的分析包括一组全基因组序列,包括89种裸燕麦和22种带壳燕麦植物,以及来自世界各地的其他四种密切相关的六倍体物种。

这项研究中对这个大数据集进行更深入分析的其他结果支持了这一观点。例如,如果裸燕麦最近从带壳燕麦中分离出来,遗传学家预计会在裸燕麦中看到种群瓶颈的痕迹,这会减少裸燕麦种群的遗传多样性。然而,科学家们发现了相反的情况:在他们的数据中:裸燕麦的遗传多样性高于带壳燕麦,而不是相反。

从数据中看到的整体情况仍然相当复杂,韩兵教授解释说:“中国莜麦的育种经历了几个阶段,包括地方品种的直接采集和利用、莜麦品种之间的杂交育种以及莜麦品种之间的杂交。-用带壳燕麦培育裸燕麦。”所有这些都会增加研究结果的复杂性,让更多关于莜麦的遗传历史有待发现。

这项工作的发现证明了大规模基因组测序的力量,可以提高对当今世界主要农作物之一的驯化历史的了解。


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