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小蛋白泛素以标记蛋白质降解而闻名,但它也被证明可以调节几乎所有的细胞过程。与泛素系统并行,各种其他泛素样修饰剂也已进化,其中Fubi尽管具有免疫调节活性,但对其研究特别少。
马克斯·普朗克分子生理学研究所化学基因组学中心研究组组长MalteGersch周围的科学家们现在首次获得了对促进核糖体(细胞蛋白质工厂)关键蛋白质Fubi控制成熟的机制的分子见解。在新开发的化学工具包的帮助下,研究人员描述了两种去泛素化酶如何提供特定的Fubi水解酶活性,从而以两层方式兼职为Fubi蛋白酶。
Fubi由细胞产生,作为与核糖体蛋白S30的融合蛋白,必须通过蛋白酶将其与S30分离才能发挥核糖体的功能。在免疫细胞中,核糖体生产的这种副产物被用作分泌的信号分子,例如局部降低子宫中母体免疫系统的活性,从而使胚胎能够植入。Fubi是如何被蛋白酶特异性识别的,以及它们如何将其与泛素区分开来,此前尚不清楚。
RachelO'Dea和MalteGersch详细解释了他们的研究:
您的发现是什么?为什么令人兴奋?
我们的团队揭示了两种去泛素化酶如何也可以充当泛素样蛋白Fubi的蛋白酶,并获得了关于如何以特定方式实现这一点的分子见解。值得注意的是,尽管泛素和泛素样蛋白之间存在相似性,但人类调节它们的酶通常并不相同。
我们证明这种双重活性是USP16和USP36两种酶所特有的,并且我们的晶体学研究从机制上解释了如何实现这种罕见的交叉反应性。令人惊讶的是,与在细菌或病毒的交叉反应酶中观察到的情况不同,我们没有发现任何额外的结构元件可以促进这些充分表征的泛素蛋白酶的额外Fubi活性。
相反,Fubi识别是通过互补结合表面上的小隐秘基序介导的。
你们开发的工具包有什么特别之处?
可能由于其具有挑战性的氨基酸组成,Fubi蛋白工具尚未被添加到研究泛素和泛素样蛋白的工具库中。
我们的工作展示了制作Fubi工具的简便方法,该领域的其他科学家可以很容易地采用这些方法。这里描述的探针和Fubi荧光底物提供了一种在细胞和体外环境中评估Fubi橡皮擦活性的方法。
为什么您的研究对科学界很重要?
我们的工作为酶如何具有跨越多个修饰系统的活性提供了新的分子见解。解释USP16和USP36如何在核糖体蛋白成熟中发挥作用,扩展了我们对调节这一关键细胞过程的机制的理解。
Fubi主要由免疫学领域的科学家进行研究,最近又由核糖体领域的科学家进行研究,我们以泛素背景研究该主题的工作补充了这些其他工作。所有数据一起汇聚到一个两层模型中进行Fubi处理。
为什么您的研究对社会很重要?
由于泛素和泛素样蛋白等翻译后修饰的快速和可逆性质,它们几乎是所有细胞过程的关键调节因子。
Fubi与免疫调节功能有关,并已被证明可以在免疫刺激反应过程中修饰蛋白质。了解Fubi在此过程中的确切作用将扩大我们对细胞如何响应免疫信号的理解。
接下来您将采取什么步骤?
我们对Fubi识别的深入了解允许在细胞中调节Fubi蛋白酶活性,从而为更好地理解这种神秘蛋白质作为翻译后修饰的细胞作用铺平道路。
此外,我们正在使用探针来促进其他蛋白质与Fubi相互作用的分子机制的研究。但首先我们要庆祝一下。
研究结果发表在《自然化学生物学》杂志上。
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