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来自SanfordBurnhamPrebys和香港中文大学的科学家表示,他们已经开发出一种计算方法来预测2型糖尿病患者是否会患上肾脏疾病。他们的研究成果“肾功能和糖尿病肾病进展的DNA甲基化标记”发表在《自然通讯》上,可以帮助医生预防或更好地治疗2型糖尿病患者的肾病。
“这项研究让我们得以一睹预测诊断的强大未来,”共同资深作者、桑福德伯纳姆普雷比学院生物信息学教授兼主任KevinYip博士指出。“我们的团队已经证明,通过将临床数据与尖端技术相结合,可以开发计算模型来帮助临床医生优化2型糖尿病的治疗以预防肾脏疾病。”
糖尿病是全世界肾衰竭的主要原因。在美国,44%的终末期肾病和透析病例是由糖尿病引起的。在亚洲,这个数字是50%。
“糖尿病患者肾脏疾病治疗方法的开发取得了重大进展,”共同资深作者、香港中文大学医学与治疗学系教授RonaldMa补充道。“然而,仅根据临床因素评估个体患者患肾病的风险可能很困难,因此确定谁患糖尿病肾病的风险最大是一项重要的临床需求。”
表观遗传生物标志物
“表观遗传标记是糖尿病和相关并发症的潜在生物标记。利用香港糖尿病登记处的前瞻性队列,我们进行了两项独立的全表观基因组关联研究,以确定分别与基线估计肾小球滤过率(eGFR)和随后的肾功能下降(eGFR斜率)相关的1,271种类型的甲基化标记物2名糖尿病受试者,”研究人员写道。
“在这里,我们显示了40个(30个之前未识别)和8个(之前全部未识别)CpG位点分别在基线eGFR和eGFR斜率方面达到了表观基因组范围的显着性。我们还开发了一种多位点分析方法,分别选择64个和37个CpG位点作为基线eGFR和eGFR斜率。这些模型在患有2型糖尿病的美洲原住民独立队列中得到了验证。我们确定的CpG位点靠近在肾脏疾病中发挥功能作用的基因附近,其中一些位点与肾损伤相关。
这项研究强调了甲基化标记物在2型糖尿病个体肾脏疾病风险分层中的潜力。”
新算法依赖于DNA甲基化,当我们的DNA中积累微妙的变化时就会发生这种情况。DNA甲基化可以编码有关哪些基因被打开和关闭的重要信息,并且可以通过血液测试轻松测量。
“我们的计算模型可以使用血液样本中的甲基化标记来预测当前的肾功能以及肾脏在未来几年的功能,这意味着它可以轻松地与当前评估患者肾病风险的方法一起实施,”说是的。
基于详细数据的模型
研究人员利用香港糖尿病登记处1,200多名2型糖尿病患者的详细数据开发了他们的模型。他们还在另一组326名患有2型糖尿病的美洲原住民中测试了他们的模型,这有助于确保他们的方法可以预测不同人群的肾脏疾病。
“这项研究凸显了香港糖尿病登记册的独特优势,及其推动进一步发现以提高我们对糖尿病及其并发症的了解的巨大潜力,”该研究的合著者、医学博士朱莉安娜·陈(JuliannaChan)指出。香港中文大学医学和治疗学教授,二十多年前建立了香港糖尿病登记册。
“香港糖尿病登记册是一座科学宝藏,”第一作者、桑福德伯纳姆普雷比学院的博士后科学家KellyYichenLi博士补充道。“他们对患者进行了多年的随访,这让我们全面了解了几十年来糖尿病患者的健康如何变化。”
研究人员目前正在努力进一步完善他们的模型。他们还扩大了他们的方法的应用范围,以研究有关人类健康和疾病的其他问题,例如确定为什么一些癌症患者对某些治疗反应不佳。
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