香蕉是世界上最重要的农作物之一。对栽培香蕉的需求持续增长;然而，它们的生产受到生物和非生物胁迫的复杂影响。例如，香蕉产量受到镰刀菌枯萎病的严重威胁，该病是由真菌尖孢镰刀菌引起的。sp。古巴。

因此，培育具有改良性状的新香蕉品种，特别是是对多种病原体的遗传抗性，对于未来的香蕉生产至关重要;高质量的香蕉基因组无疑将促进这种基因操作。

卡文迪什型香蕉具有单种Musaacuminata起源(AAA)，约占全球香蕉产量的一半，因此对人类社会具有重要意义。然而，到目前为止，香蕉品种的高质量单倍型解析参考基因组仍未被解码。在这项研究中，报道了“八喜娇”(卡文迪什)的端粒到端粒(T2T)和单倍型解析的参考基因组。

该参考基因组由三个单倍体组件组成，其大小估计分别为477.16Mb、477.18Mb和469.57Mb。基因组质量评估证实了基因组的连续性(LAI：19.84、20.65和20.22)和完整性(BUSCO：97.40%、97.80%和93.80%)。在三个单倍体组件中，分别鉴定出19、17和17个端粒。就重复区域而言，识别出256.48Mb(53.76%)、258.29Mb(54.14%)和258.84Mb(55.13%)。

NLR位点在Musaacuminata(MAv4)和'Baxijiao'基因组中的分布。图片来源：园艺研究

此外，从每个组装中总共预测了37,185、37,241和37,178个高置信度蛋白质编码基因。尽管具有单特异性起源，但这三个单倍体组装体表现出巨大差异，且序列共线性水平较低。在1、4和7号染色体之间发现了几个大的相互易位。

检测到可能影响果实品质和香气的基因家族的扩展，例如属于蔗糖/二糖/低聚糖分解代谢过程、蔗糖代谢过程、淀粉代谢过程和芳香化合物生物合成过程的基因家族。此外，观察到与花药和花粉发育相关的基因家族的扩展，这可能与卡文迪什品种的单性结实和不育有关。

最后，在‘八溪椒’中鉴定出的抗性基因比在M.acuminata中少得多，特别是在3号和10号染色体的基因簇中，为探索抗病性的分子分析提供了潜在的靶点靶点因此，这个T2T单倍型解析的参考基因组将成为香蕉生物学研究、分子育种和遗传改良的宝贵遗传资源。

文章《端粒到端粒单倍型解析的参考基因组揭示了三倍体卡文迪什香蕉的亚基因组分歧和抗病性》已发表在《园艺研究》上。

版权说明：本站所有作品图文均由用户自行上传分享，仅供网友学习交流。若您的权利被侵害，请联系我们

标签：