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《分子生物学与进化》上的一篇新论文首次提供了一套全面的穿山甲(有时称为鳞食蚁兽)基因组资源,研究人员认为这些资源对于保护这些受威胁的哺乳动物至关重要。
这项工作的标题是“穿山甲基因组为世界上被贩运最多的野生哺乳动物提供了关键的见解和资源”。
穿山甲生活在亚洲和撒哈拉以南非洲,是唯一全身覆盖鳞片的哺乳动物。它们因其肉和所谓的药用特性而被贩运,数量创历史新高。由于原生栖息地的广泛森林砍伐,这些动物也面临危险。穿山甲由八个幸存物种组成,近年来引起了公众的极大兴趣和保护工作。这主要是因为它们是地球上被贩运最多的野生哺乳动物,而且最近(错误的)暗示它们可能与COVID-19大流行有关。
尽管保护环境严峻,但穿山甲的研究还不够充分,基本物种或种群研究仍存在重大差距。研究人员现在越来越关注野生动物研究中的基因组学,因为它提供了有关物种或种群划分、人口统计信息、多样性、历史轨迹以及动物对全球变化的适应能力等更准确信息的数据。它还可以帮助追踪非法交易个体的来源,以便更有效地确定偷猎热点并破坏贩运网络。
产生有关穿山甲的全基因组信息是一项具有挑战性的任务。首先,穿山甲物种之间的地理隔离和有限的化石记录造成了方法学障碍。亚洲和非洲穿山甲物种在大约3790万年前发生了分化,因此在使用遥远物种的参考基因组时很难真正了解该群体的进化。其次,这些动物难以捉摸的行为和热带分布使得基因采样既昂贵又耗时。
这里的研究人员对原产于非洲的巨型穿山甲的第一个参考基因组进行了测序、组装和注释,还对黑腹穿山甲、特明克穿山甲、印度穿山甲和菲律宾穿山甲的基因组进行了测序和组装。这些新的基因组数据,加上之前发表的关于其余三个物种——白腹穿山甲、巽他穿山甲和中华穿山甲——的信息,提供了第一套完整的穿山甲基因组。在此过程中,研究人员还从之前发布的基因组数据中鉴定出了一种潜在的新穿山甲物种。
研究人员相信,这些信息最终将提供有关穿山甲如何随着时间的推移进化以应对不断变化的环境条件的完整信息,并将提供有关如何通过未来几年的保护优先事项和管理计划有效保护动物的重要细节。这些成果还将有助于开发追踪穿山甲贸易的DNA工具包。
该论文的作者之一肖恩·海顿(SeanHeightton)表示:“这项研究的作者来自非洲、亚洲和欧洲,通过合作的方式,我们首次能够使用全基因组视角深入研究所有八个物种的穿山甲进化。”作者。“我们希望这些基因组将成为进一步基因研究的基础,这将有助于保护动物。”
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