一组国际研究人员发表了第一份关于乳酸菌(LAB)的全面比较全基因组分析，乳酸菌是自然生态系统和食品工业所必需的微生物家族。该研究发表在《食品微生物学》上，由诺和诺德基金会生物可持续性中心(DTUBiosustain)和加州大学圣地亚哥分校的科学家进行。

这项新研究代表了理解26个LAB物种遗传能力的关键飞跃，这是首次进行全科全基因组分析。通过分析2,400多个公开的高质量基因组，研究人员成功绘制了乳杆菌科26个物种的单个菌株的功能遗传能力、代谢途径和生物合成基因簇。

研究人员开发了一种用于大规模全基因组分析的新型集成工作流程，包括数据管理、分类学定义、系统群识别、全基因组重建、功能注释和基因组挖掘等重要步骤。与之前专注于单个物种或宏基因组研究的努力相比，这种先进的计算分析可以更好地理解不同LAB物种之间的功能差异。

主要作者之一、来自DTUBiosustain的博士后OmkarSatyavanMohite表示：“在绘制LAB的遗传图谱时，我们打开了通向以系统发育群体和个体菌株为代表的新可能性宝库的大门，以用于未来的生物技术应用。”研究的。

可以推动食品工业和医疗保健的进步

这项研究的成果不仅限于微生物的数据科学研究;他们有实际应用。“我们已经为从物种鉴定和功能研究到系统发育研究和生物技术创新的各个方面奠定了基础。这项工作可以推动各个领域的进步，包括食品工业、医疗保健和环境科学，”博士后AkankshaRajput说加州大学圣地亚哥分校的研究员，也是该研究的主要作者之一。

这项研究对于学术、工业、医学和环境领域的专家和研究人员尤其重要，他们所有人都可以利用这些数据驱动的见解来优先考虑所需遗传背景的菌株。

研究人员表示，未来的工作将使用泛基因组特征作为深入研究细菌进化、代谢途径或序列水平变异的关键工具。这里收获的集成全基因组分析工作流程可能是进一步研究具有工业相关性的其他微生物群的重要平台。

该研究的通讯作者是BernhardO.Palsson教授。该研究由AkankshaRajput(加州大学圣地亚哥分校博士后研究员)、SiddarthChauhan(加州大学圣地亚哥分校博士生)和OmkarS.Mohite(DTUBiosustain博士后研究员)领导。合作者包括来自DTUBiosustain微生物食品、重建团队和基因组分析的团队。

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