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用于rDNA高通量测序文库构建的固相可逆固定珠

开心的月饼 2023-10-14 09:19:57 健康养生

固相可逆固定(SPRI)珠广泛用于高通量测序文库构建,以纯化和回收核酸。发表在Zoonoses上的一项新研究调查了全长16SrDNA高通量测序文库构建过程中SPRI珠子比例、孵育时间和洗脱时间对核酸回收率的影响。

用于rDNA高通量测序文库构建的固相可逆固定珠

比较了不同SPRI珠子比例、孵育时间和洗脱时间对三种不同初始样品量的影响。设计L9(33)正交实验来确定这些因素的最佳组合。

对于初始样品量1,500ng和3,000ng,SPRI珠子比例、孵育时间和洗脱时间三个因素的孵育时间对回收率的影响具有统计学意义。正交实验结果表明,三个因素中孵化时间的影响最大。

孵育时间显着影响全长16SrDNA高通量测序文库构建的回收率。使用0.8×SPRI珠子、孵育15分钟、洗脱10分钟获得最高的回收率。SPRI微珠提供了一种恢复全长16SrDNA扩增子的可行方法。


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