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一篇新研究论文介绍了香蕉多样性的前沿目录,利用创新的基因组技术追溯各种香蕉品种的祖先起源。这项研究涉及多个机构的合作,并包含一份全面的栽培香蕉目录。
我们正处于基因组学飞速发展的时代。技术正在彻底改变我们理解自然界的方式。随着基因组测序成本的下降,研究人员现在可以研究更多的植物,并重新构想我们如何表现植物多样性。这让我们能够采用一种更全面的方法,将基于物理特征的传统视觉分类与来自遗传数据的额外多样性相结合。
最近,我们对栽培香蕉基因组的了解取得了进展,并促成了一种名为“计算机染色体绘画”的创新技术的发展。这种基于计算机的方法可以追溯栽培香蕉品种染色体的祖先起源。该技术已应用于国际基因库的许多种质,以及东南亚和太平洋地区新收集的材料。
该项合作研究由国际生物多样性联盟和国际热带农业中心、法国国际农业研究与发展中心、美国农业部农业研究局热带农业研究站(美国波多黎各)、巴布亚新几内亚国家农业研究所以及库克群岛和萨摩亚农业部的研究人员共同开展,研究结果最近发表在《植物、人类、星球》杂志上。,为香蕉多样性提供了新的见解。
最终,研究人员获得了一系列色彩鲜艳、马赛克状的染色体图像,这些染色体可被视为许多不同香蕉品种的基因组特征,例如著名的卡文迪什香蕉或大蕉。这项研究还发现,一些当地广受欢迎的香蕉品种,如PisangAwak或MaiaMaoliPopoulu,并非由单一克隆组成,这为研究通常在单克隆田中种植的作物的多样化开辟了有趣的视角。
尽管马赛克是通过自动化生物信息学程序获得的,但这项研究的共同第一作者AlbertoCenci回顾了这一成就背后的分析:“这是对自动化分析的精心策划和无数小时的集体努力的结果,以分析和理解这些马赛克背后的机制。”
他的同事兼项目合作者、生物信息学专家凯瑟琳·布雷顿乐观地指出,还有更多令人兴奋的可能性:“凭借我们积累的丰富知识和人工智能,我们可以简化和加速这一过程。事实上,我们已经看到了有希望的结果。”
旅程还远未结束。朱莉·萨多斯(JulieSardos)是香蕉多样性专家,也是这项研究的共同第一作者,她指出,还有许多东西有待发现。根据论文中提出的结果以及她在亚洲和大洋洲(香蕉的起源地)的广泛实地考察,她相信未来的任务将带来更多令人兴奋的发现。
在另一项针对东南亚大陆的研究中,研究人员在野生香蕉中发现了隐藏的多样性,这表明该地区可能还隐藏着更多的栽培多样性。
她说:“随着香蕉多样性的探索不断进行,我期待继续用新的染色体嵌合体来扩充这个目录。”
参与这项研究的首席科学家之一MathieuRouard强调了这项工作的重要性。
“我们花了几年时间完善这个目录概念,我们很高兴它能发布并得到使用。研究结果可能会对农业系统、育种产生积极影响,并改善我们在联盟国际香蕉基因库中的保护工作,”他说。
随着萨多斯及其同事等科学家继续探索香蕉和其他作物的遗传多样性,该目录将继续更新和扩充。该资源现在既可打印,又可在线使用。
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