在报道像美国人类遗传学学会(ASHG)年会这样的大型会议时，最大的挑战之一是在少数故事中捕捉全部内容。上周，GEN的编辑团队发布了三份特别版时事通讯，涵盖了会议上的最大新闻，包括活动之前的突发新闻——FDA咨询委员会对VertexPharmaceuticals基于CRISPR的镰状细胞病疗法的评估。我们还在对首席执行官ChristianHenry的独家采访中介绍了PacBio作为一家公司的演变。

但重要的是要承认学术和工业实验室中发生的所有变革性科学，这些是华盛顿特区会议期间众多演讲和海报的主题。以下是今年提出的其他一些值得注意的研究的一些亮点。

多样性对于大型数据集很重要

阿斯利康(AZ)科学家所做的研究结果强调了生物样本库等大规模计划参与者多元化的重要性。AZ统计遗传学家肖江博士在会议上展示了这些数据。在他们的研究中，该团队评估了英国生物银行超过490,000个基因组中CYP2D6(一种重要的药物基因)基因型的证据。他们获得了超过222,000名生物银行参与者的处方数据，根据特定的星等位基因模式将可待因分为不良、正常、中等或超快速代谢者。

研究小组在生物库中发现了来自非欧洲血统个体的有限基因组信息，以及有关这些人群中特定基因如何代谢的有限数据。这意味着5%至6%的非裔美国人、混血儿和南亚人不能被归入任何一类，而来自欧洲和东亚的人只有2%左右。这使得很难提供有关药物剂量和治疗选择的基于证据的建议。

此类发现引发了关于大规模研究中多样性重要性的更广泛讨论，ASHG主席、医学博士、哲学博士BrendanLee在会议的开幕致辞中也强调了这一点。

无细胞癌症检测策略

不需要侵入性手术的改进的癌症检测方法始终是一个受欢迎的发展。一项演讲重点讨论了使用nullomer(无细胞RNA中发现的DNA短片段)作为肝细胞癌(HCC)等癌症的非侵入性生物标志物的可能性。这项工作由宾夕法尼亚州立大学医学院的医学博士/博士生奥斯汀·蒙哥马利(AustinMontgomery)提出，并与雅典国立技术大学和加州大学旧金山分校的科学家合作完成。他们的研究结果表明，nullomer可能是比游离DNA更敏感的生物标志物，因为它们仅在存在基因突变的情况下才被检测到。事实上，据研究小组称，大约80%的突变会导致nullomer出现。此外，一些癌细胞热点含有突变特征，这些突变特征似乎更有可能导致寡聚物的出现。

在HCC的背景下，研究人员将超过90%的已鉴定的nullomer与肝脏相关基因联系起来。他们还将寡聚体与胃癌和肺癌相关的基因连接起来。

编辑亨廷顿病

除了镰状细胞病之外，科学家们还将基于CRISPR的编辑应用于一系列疾病。这包括亨廷顿舞蹈症(HD)，这是一种影响大脑神经细胞的遗传性疾病。在加州大学伯克利分校(UCB)，科学家们使用基因编辑技术和其他工具来编辑导致致命神经退行性疾病发展的突变HTT基因。加州大学伯克利分校计算生物学研究生CamelleCatamura介绍了该研究的详细信息。该团队的方法包括删除HTT基因的部分并用工程DNA序列替换它们，以阻止异常蛋白质的产生。需要明确的是，仍有工作要做，但战略性地编辑基因的目标部分以创建新的外显子被证明是一种可行的限制或减少异常mRNA表达的方法。

病毒与阿尔茨海默氏病的联系

会议上发表的一项研究将几种疱疹病毒与阿尔茨海默病(AD)风险联系起来。波士顿大学医学院生物信息学博士生MarleneTejeda提出的研究结果还包括与AD相关的几个基因。来自凯斯西储大学、迈阿密大学和宾夕法尼亚大学的科学家也在致力于该项目。在这项研究中，该团队使用了阿尔茨海默病测序项目生成的数据，其中包括来自欧洲、加勒比西班牙裔和非裔美国人血统的数据。根据该报告，他们观察到疱疹病毒与HLA-DQA1和POTEE等新基因之间存在显着关联。他们还确定了CASS4和FOXF1等AD风险相关基因与疱疹病毒之间的联系。

GnomAD4.0已发布

最后，基因组聚合数据库(gnomAD)4.0版(人类遗传变异的大规模聚合数据集)现已推出。布罗德研究所的研究人员带头构建和维护该资源。据其开发人员称，该版本的资源比之前一些版本的总和大了近五倍。它拥有来自该数据集先前版本中超过730,000个外显子组的序列数据以及来自超过76,000个个体基因组的数据。它总共包含来自超过807,000人的序列数据，其中包括约138,000名非欧洲血统的人。发布的完整详细信息可以在项目网站上找到。

在ASHG上，至少有两次演讲重点关注gnomAD。其中一个讨论了用于处理和质量控制该计划生成的大量数据的生物信息学框架。第二个演讲探讨了一些关于基因功能的见解，这些见解可以从一个更大、更多样化的数据集中收集到。

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