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华盛顿特区——在上周举行的美国人类遗传学学会(ASHG)会议的2023年主席研讨会上,该学会主席布伦丹·李(BrendanLee)邀请的三名发言人展示了进展,用李的话来说,这些进展说明了“诊断的力量和治疗。”
“这不是一项西西弗斯式的任务,”李说。
开幕式由医学博士、博士DennisLo主持,他是无创产前诊断和液体活检领域的先驱。
1997年,Lo的团队表明,胎儿会释放无细胞DNA(cfDNA),在妊娠10周时可在母体血液中检测到。到2008年,他的团队表明,对血浆中的cfDNA进行随机测序,然后将这些序列映射回各自的染色体,可用于测量染色体比率。这使得唐氏综合症的检测准确率达到99%。2011年进入临床实践,目前全世界每年进行数百万次此类测试。
Lo和同事还表明,这项技术可用于癌症的早期检测。一个很好的例子是鼻咽癌(NPC),它与Epstein-Barr病毒(EBV)有关。该测试使用相隔一个月的两轮cfDNA筛查,揭示了患有鼻咽癌的高风险个体。如果两项测试均为阳性,患者将接受内窥镜检查和其他测试。在对香港20,000名受试者进行的一项调查中,Lo的团队发现了34例鼻咽癌病例,其中大多数处于第一阶段。这种早期发现使鼻咽癌死亡率降低了十倍。四年后的第二轮筛查中,又发现了24例病例。
Lo引入了“片段组学”这个术语。事实证明,胎儿cfDNA片段平均比循环中的母体DNA短一些。现在,他的团队正在试验长读长测序,十多年来一直依赖短读长测序。Lo说,在怀孕和癌症中,15-30%的cfDNA存在于长DNA片段中。“在过去的25年里,”他解释道,“我们一直在查看怀孕期间的短信。现在我们可以查看Word文档了!”
治疗进展
李的第二位演讲者是医学博士唐纳德·科恩(DonaldKohn),他是加州大学洛杉矶分校的一位领先的儿科血液学家,开创了针对自身免疫性疾病和其他血液疾病的基因疗法。
Kohn说,基因疗法具有三个主要优点:1)单一的“一次性”治疗;2)针对未满足的医疗需求的潜在治疗方法;3)能够在几十名患者的试验中测试疗效。在过去的几年中,基因疗法已被批准用于治疗遗传性失明(Luxturna)、脊髓性肌萎缩症(Zolgensma)、血红蛋白病(Zynteglo)、血友病(Hemgenix)和杜氏肌营养不良症(Sarepta)。
Kohn的团队与伦敦大学学院的ClaireBooth博士合作,对腺苷脱氨酶缺乏症(ADA-SCID)(一种严重的联合免疫缺陷症)患者进行了试验,最近报告了使用碱基编辑治疗其他疾病的令人兴奋的进展。SCID的遗传形式。
Kohn随后回顾了镰状细胞病(SCD)的进展,该病患者的平均寿命为45年。多种方法在临床上显示出前景,包括使用慢病毒载体进行基因添加(BluebirdBio);BCL11A红细胞增强子的siRNA破坏;以及靶向γ-珠蛋白启动子序列以增强基因表达。碱基编辑在直接编辑β-珠蛋白基因中的SCD突变方面显示出了前景。Vertexexa-cel试验将于下个月加速获得FDA批准。
精准肿瘤学
在会议的最后演讲中,芝加哥大学肿瘤学家OlufunmilayoOlopade博士发表了关于乳腺癌精准医学的激动人心的演讲。她首先回忆了20世纪90年代初“一个了不起的黑人家庭”,其中一名34岁的女性来到这里接受乳腺癌检测,与家庭的每一位成员和五代家谱一起。先证者可能会死于卵巢癌,但自从发现BRCA1以来,Olopade一直倡导在常规癌症治疗中使用基因检测。
奥洛帕德强调了美国乳腺癌死亡率的种族差异。她说,在20世纪70年代,由于缺乏有效的药物,没有统计学上的显着差异。但她说,自从(对某些人)使用乳房X光检查和他莫昔芬以来,尽管黑人女性ER阳性癌症的发病率较低,但其死亡率却明显较高。她说,总体而言,死亡率存在40%的差距。
她接着讨论了对适合人口统计的参考基因组的需求以及开发基于生物标志物的疗法的需求。她说,目标是“在正确的时间针对正确的药物”。她目前正在研究多基因风险评分,以帮助筛查黑人乳腺癌患者。
她说,最终目标是主流基因检测。“如果可以进行基因检测,你会接受吗?”她问。我们的目标是开发所有患者都能负担得起的检测方法,否则,结果将只是扩大医疗保健差距。“然后我们将提供个性化护理,”奥洛帕德说。
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