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虽然斯瓦米·维贾扬(SwamyVijayan)博士的职业生涯始于理论物理学,但他的大部分职业生涯都在生物技术行业工作。他的职业生涯包括在Illumina工作一段时间以及推出Omniome,这是一家短读长测序公司,于2021年被PacificBiosciences收购。他的下一份工作是在作为Zafrens的药物发现公司首席执行官,Zafrens是一家正在开发多模式平台的公司,该公司押注该平台将撼动药物发现市场。
本周,Zafrens宣布完成由PrimeMoversLab领投的2300万美元融资,BlueYardCapital、KOFAHealthcare、GlobalBrains、FoundersXVentures、AlixVentures、PossibleVentures、IasoVentures、Hawktail和其他投资者参与。这些资金将帮助Zafrens优化其Z-Screen平台的应用,并支持推进潜在新药化合物内部管道的工作。
原则上,Z-Screen旨在将药物发现过程的多个要素浓缩到一个平台中。这意味着将使用大型组合化学库的传统细胞检测与单细胞测序和成像数据结合起来,以评估复杂细胞共培养相互作用的分子和功能基础。大型CRISPR、CAR-T、mRNA文库以及内源分子异质性可以映射到细胞行为、细胞间相互作用和分泌。
当Vijayan和他的团队于2022年1月开始开发该平台时,他们的目标之一是设计一个不严重依赖自动化的灵活平台。Vijayan在接受采访时告诉GEN这很重要,因为“我们希望能够在世界任何地方、在真正的环境下进行真正的高通量实验”高分辨率。”他们还希望扩展传统的96孔板,这是药物发现的主要内容。Z-Screen拥有50,000–200,000个微孔,这些微孔安装在小型玻璃或塑料基板上,每个微孔可容纳一个细胞。Zafrens目前并未透露有关该技术机制的细节。
在接受GEN采访时谈到该平台GEN时,Vijayan解释说Z-Screen可用于组合各种细胞类型并观察如何组合他们在文化中互动。这类研究构成了“我们技术的第一个支柱,即能够进行真正、真正高通量的纵向共培养实验,”他解释道。这方面的一个例子可能是观察T细胞和肿瘤细胞之间的相互作用,以确定最有效地攻击和杀死癌细胞的特定细胞亚群,或研究B细胞抗体。
Zafrens的第二个支柱集中于将单个细胞的遗传学和成像结合起来。“这使我们能够绘制细胞分子状态的功能表现图,”Vijayan说。回到T细胞的例子,利用这些数据,科学家可以详细研究T细胞的激活或评估它们对疲劳的抵抗力。最后,该公司可以在一次实验中评估将单个细胞暴露于小分子库或其他扰动的影响。该公司使用独特的条形码化合物,这些化合物附着在珠子上并通过暴露在光线下裂解。通过对暴露于条形码化合物的细胞进行成像,Zafrens捕捉到它们对不同化合物的反应。由于该公司还对细胞进行测序,因此他们还可以收集有关药物化合物影响的基因组水平信息,例如任何脱靶效应以及细胞反应所涉及的分子途径。他们还可以识别负责调节观察到的反应的分子之间的关系。
多模式药物发现平台的市场正在不断增长。近年来,其他公司推出了将不同类型的数据纳入药物发现过程的商业平台。例如,EikonTherapeutics’平台使用超分辨率显微镜成像来揭示活细胞中的蛋白质行为。与此同时,Recursion的平台结合了高维生物和化学数据集的信息,创建生物关系图,帮助他们识别新靶点和药物化合物。
Zafrens数据的数量和规模是其关键的优势之一。“通过测量暴露于大量扰动和外部相互作用时的全细胞转录组、蛋白质组和成像反应,Zafrens创建的数据集比单蛋白结合测量复杂几个数量级,揭示了微妙细胞行为的因果基础。”BlueYardCapital执行合伙人兼Zafrens董事会董事JasonWhitmire表示
它是由数千个细胞生成的大量数据,将结构与基因组或基因表达谱和功能联系起来。目前,Zafrens尚未使用人工智能,但Vijayan表示,随着公司收集更多信息,最终将开始使用人工智能模型根据数据进行预测。Zafrens已经开始研究一些人工智能模型,但这些模型还处于起步阶段。“我们仍在收集大量数据、表征它们、验证它们等等,”他说。“我认为大约一年后,这将成为我们最重要的资产。”
在未来的几个月里,Z-Screen可能会通过多种途径得到应用。该公司建立了合作伙伴模式,并正在积极与药物开发商合作。例如,Zafrens可以与正在开发新细胞疗法或抗体发现项目等的公司合作。
目前,该公司打算与专注于其内部某些专业领域的合作伙伴合作—快速、独立于HLA、高度-选择性TCR发现,以及跨3'UTR调节、剪接和表观遗传重编程的RNA调节小分子。Zafrens还在寻求专注于CAR-T优化和双特异性药物发现或小分子组合文库、遗传扰动和细胞间相互作用可能产生突破的合作伙伴关系。
另外,Zafrens正在开发针对常见癌症突变的RNA调节小分子和HLA不可知的TCR库的内部管道。它还正在建立一个有能力的跨学科团队,汇集了测序、工程、化学等方面的专业知识。到目前为止,公司共有员工约30人。
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