许多癌症，包括某些类型的乳腺癌，都是由称为激酶的细胞酶活性的改变引起的。直接抑制这些促癌活性的疗法已被证明对于可以诊断出个体驱动激酶的患者是有效的。

这种治疗方法的一个主要挑战是准确量化人体活检样本中的肿瘤激酶。许多激酶的存在量并不丰富，因此更难以准确测量。尽管目前有量化少量激酶的方法，但在快速数据返回至关重要的临床环境中同时测量多种激酶是麻烦且不切实际的。

开发丰富临床样本中激酶的方法至关重要，这是迈向有效个性化医疗的重要一步。现在，研究人员和贝勒医学院及合作机构在《临床蛋白质组学》上发表了一项研究“临床蛋白质组学的激酶抑制剂下拉(KiP)测定”，该研究涉及KiP的开发，该KiP可以最佳地富集和量化活检中存在的少量激酶样品与质谱技术相结合。

研究人员以单次方法建立了激酶测定的覆盖范围和定量保真度，优化了100个激酶靶向组，并确定了KiP在对乳腺癌患者动物模型和两个乳腺癌患者样本组进行亚型分型方面的有效性。

“最初在16个患者来源的异种移植模型(PDX)中评估了优化的检测方法，其中KiP鉴定了多种差异表达和生物学相关的激酶。根据这些分析，开发了一种优化的单次平行反应监测(PRM)方法来提高定量保真度。然后，PRMKiP方法被重新应用于人类癌症核心针活检中典型产量的少量蛋白质，”研究人员写道。

初始目标

针对100种激酶的初始原型概括了从全面的蛋白质组学和转录组学分析中获得的PDX模型的内在亚型。随后通过KiP-PRM对Luminal和HER2富集OCT冷冻患者活检进行分析，也按亚型进行聚类。最后，开发了稳定同位素标记的肽标准品来定义原型临床方法。数据可通过ProteomeXchange获取，标识符为PXD044655和PXD046169。”

“我们的研究代表了先进技术的融合，重新定义了基础医学研究，并为未来的临床应用铺平了道路，”贝勒质谱蛋白质组学核心高级生物信息学分析师、第一作者AlexanderSaltzman博士说。

共同通讯作者MatthewEllis补充道：“本文强调，蛋白质质谱的新方法有望更好地定义每种癌症中存在的个体可药物景观，并且应该更广泛地用于研究，并最终用于临床护理。”博士，贝勒莱斯特和苏史密斯乳腺中心的教师。

“这种方法用于识别癌症中的关键激酶，甚至可能超越这些酶，进入其他低丰度和生物学相关的靶点，”共同通讯作者、阿斯利康公司副主任兼助理教授Beom-JunKim博士说。研究期间在贝勒大学。

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