甜樱桃(PrunusaviumL.)是温带地区生长的最具经济重要性的多年生水果品种之一。然而，部分由于气候变化和病原体带来的生物压力，法国甜樱桃产量自20世纪80年代以来一直在下降。

同时，传统育种由于幼体期长、多基因性状复杂，是一个漫长的过程。包括数量性状基因座(QTL)作图和全基因组关联研究(GWAS)在内的遗传学研究的进展已经确定了关键性状的标记，但由于需要广泛的基因分型而受到限制。测序基因分型(GBS)是一种很有前途的解决方案，为高密度SNP分析提供了一种经济有效的方法，以增强育种策略。

2023年9月，园艺研究发表了题为“甜樱桃种质资源库(PrunusaviumL.)的全基因组关联图谱揭示了水果品质性状的候选基因”的研究。

本研究首先利用116个甜樱桃种质资源，在2-6年的时间里调查了23个果实品质性状，观察到果实品质性状的高表型变异。然后，通过测序基因分型(GBS)方法对SNP进行分析。

对P.aviumv​​ar.中的28198、34864和33760个SNP进行了全基因组关联研究(GWAS)。“Regina”，P.avium变种。分别是“Satonishiki”和“Prunuspersica”“PLov22n”基因组。此外，通过使用两个多位点模型和三个参考基因组的GWAS，共鉴定出8个性状的65个独特的SNP-性状关联。研究人员还确定了几个与植物激素、钙和细胞壁代谢有关的候选基因。

为了确定果实品质性状的潜在共定位SNP关联，研究人员总结了本研究和之前发表的9篇文章的结果，并鉴定了11、12个与果实大小(果实重量、果实宽度和果实厚度)相关的候选基因和与果实开裂相关的性状。

该研究稳健的方法涵盖了表型变异的表征，揭示了所检查性状的显着变异性，许多性状具有较高的广义遗传力，表明存在强大的遗传成分。GBS测序产生了丰富的SNP数据集，经过质量和次要等位基因频率过滤后，有助于识别多个性状之间的遗传关联。

种群结构分析揭示了不同的亚种群，有助于更深入地了解集合内的遗传多样性。所确定的SNP-性状关联，得到精确文献综述的支持，用于比较和标记-性状关联的潜在共定位，增强了我们对甜樱桃果实品质遗传控制的理解。

总体而言，这些知识支持了标记辅助选择策略的开发，旨在加速育种工作，以满足消费者的偏好和生产者的需求，从而解决甜樱桃遗传结构的复杂性及其对果实品质性状的影响。

版权说明：本站所有作品图文均由用户自行上传分享，仅供网友学习交流。若您的权利被侵害，请联系我们

标签：