现代育种侧重于遗传分析和种质管理，并在改变作物基因组方面占主导地位，但常常忽视对于理解性状至关重要的非加性遗传效应。杏仁[PrunusdulcisMiller(DAWebb)]具有显着的经济和遗传研究价值，但目前的研究面临局限性，包括对加性模型的狭隘关注和有限的种质多样性。

扩大研究范围以涵盖更广泛的种质和非加性效应，可以更深入地了解杏仁驯化和遗传多样性，揭示数千年来形成的重要等位基因和QTL。

园艺研究发表了题为“杏仁群体基因组学和非附加GWAS揭示了对杏仁传播历史以及坚果性状和开花时间候选基因的新见解”的研究。

本研究利用群体结构分析、加性亲缘关系、系统发育树构建和主成分分析(PCA)相结合的综合方法来阐明243个杏仁品种的遗传结构以及基因型和表型之间的加性和非加性关联。遗传结构分析将这些品种分为五个不同的祖先群体，所有这些群体都由具有共同起源的品种组成。

其中一组仅由西班牙品种组成，而其他组则主要由来自中国、意大利、法国和美国的品种组成。PCA强调祖先群体的分离，并强调混合种质的中心定位。这些结果与考古和历史证据相一致，即现代杏仁的传播发生在四个阶段：亚洲、地中海、加利福尼亚和南半球。

基因组分析揭示了与驯化和选择压力相关的等位基因频率的差异，精确定位了1、4和5号染色体上的感兴趣区域。值得注意的是，连锁不平衡衰减相对较短，强调了定位关键杏仁性状候选基因的精确性。

研究确定了坚果重量、裂果率、双仁率和开花时间的13个独立QTL，主要表现出非加性效应。通过候选基因分析，本研究提出Prudul26A013473为裂果率主QTL候选基因，Prudul26A012082和Prudul26A017782为双仁率QTL候选基因，Prudul26A000954为开花时间QTL候选基因。这对于了解杏仁和其他潜在李属物种的基因型-表型相互作用具有重要意义。

总之，这项研究将遗传分析与历史和考古证据相结合，提供了杏仁遗传多样性的全面视图，并揭示了其在全球传播的复杂历史。QTL和候选基因的鉴定为育种和保护策略提供了宝贵的见解，强调了在作物改良计划中考虑非加性遗传效应的重要性。

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