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在《细胞分子生物学》上发表的一篇新论文中,Allin实验室(IBC)报告称,SARS-CoV-2N蛋白的相分离很大程度上取决于所选的缓冲液和pH值。例如,单个组氨酸侧链的质子化会影响蛋白质相分离与否。
SARS-CoV-2结构核衣壳(N)蛋白参与病毒基因组包装,文献报道在RNA存在的情况下会发生相分离。使用已发表的实验中未使用的磷酸盐缓冲液,研究人员感到困惑的是,他们无法在pH7.2下重现相分离,而只能在非生理pH6下重现。
他们表明,磷酸盐缓冲液中这两个pH值下相分离行为的差异是由于单个组氨酸侧链的质子化状态造成的。
然后,他们将实验扩展到描述N蛋白相分离的已发表文献中使用的缓冲液。他们发现一些缓冲液直接与N蛋白相互作用,并且缓冲液的选择会影响蛋白质在pH7.2时的净电荷,这也为为什么需要不同的RNA量来影响该pH下的相分离行为提供了理论依据。
结果表明,缓冲液和pH值的选择必须同时考虑,尤其是在从体外实验中得出有关细胞情况的结论时。关于最初的实验,需要较低的pH值来诱导相分离,有趣的是,病毒感染会导致细胞pH值降低,这可能通过促进N蛋白的相分离来帮助病毒复制。
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