芭蕉属包括大约70种草本植物，主要​​分布在亚洲和大洋洲的热带和亚热带地区。该属因是全球最重要的粮食作物和市场上流行的观赏植物之一而闻名。

尽管第三代测序技术在产生高质量基因组方面做出了重大贡献，但香蕉品种、其野生近缘种和芭蕉内的观赏物种的基因组资源仍然缺乏，这阻碍了作物和观赏植物的改良品种。

MusaornataW.Roxburgh(密苏里州)和MusavelutinaH.Wendl。&Drude(Mv)属于芭蕉科芭蕉科。它们与Musaacuminata关系密切，原产于孟加拉国、缅甸和印度东北部。这些物种不仅在热带地区作为流行的观赏植物广泛种植，而且还通过其果实为当地饮食做出贡献。

因此，Mo和Mv是高质量基因组测序的理想候选者，以增强未来的分子育种。在本研究中，Mo和Mv的染色体水平基因组组装是使用OxfordNanopore长读长和Hi-C读长生成的。Mo和Mv的基因组被组装成11条假染色体，基因组大小分别为427.85Mb和478.10Mb。

重复序列分别占Mo和Mv总基因组的46.70%和50.91%。基因组质量评估证实了两个基因组的连续性(LAI：13.68和16.81)、准确性(Illumina读数的映射率：95.55%和94.29%)和完整性(BUSCO：98.08%和98.51%)。

根据基因预测，Mo和Mv分别注释了39,177个和31,256个高置信度蛋白质编码基因。与Musaacuminata和Mv相比，Mo的chr04上观察到多个较大的倒位和易位。差异表达基因(DEG)和基因本体(GO)富集分析表明，Mv成熟果皮中上调的基因主要与糖代谢相关。过程，特别是在细胞壁和细胞外区域。

此外，还鉴定出几种多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因，与其他组织相比，它们在Mv成熟果皮中表现出更高的表达水平，这可能是果皮开裂的原因。此外，本研究还鉴定了与花青素生物合成途径相关的基因。

总而言之，Mo和Mv的染色体水平基因组组装为香蕉果皮开裂和花青素生物合成的机制提供了有价值的见解，这将对未来的遗传和分子育种工作做出重大贡献。

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