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我们的遗传密码包括 15,000 多个特定部分,这些部分可以制成称为 lincRNA 的分子。其中一些部分可能出现在我们基因组的盘绕部分中,称为 TAD。来自 TAD 的 LincRNA 似乎充当标记,指示它们所在的特定组织类型。当这些组织出现问题时,这些标记物可以帮助进行有针对性的医疗干预。发现这一新特征的团队概述了一种将这一想法应用于不同疾病的方法,并用一种称为肥厚性心肌病的心脏病进行了证明。
疾病会影响我们身体中非常特定的组织,但目前的治疗往往在它们影响的区域不分青红皂白。出于这个原因,医学领域对更具体的靶向治疗进行了大量研究。一种研究途径在于探索我们遗传密码中相对较新发现的部分,称为长基因间非编码 RNA 或 lincRNA。我们基因组上复制或转录 lincRNA 的区域曾被称为垃圾 DNA,但越来越多的研究表明这些区域绝不是垃圾。
东京大学生物科学系 Tsunoda 实验室的 Yu Hamba 说:“最近,我感到有动力去发现是什么让 lincRNA 与更熟悉的用于制造或表达蛋白质的信使 RNA 不同。” “我想全面描述解释不同类型 RNA 之间表达特异性差异的机制。信使 RNA 必须合成蛋白质,而 lincRNA 可以在不制造蛋白质的情况下发挥作用,并且似乎对它们所表达的内容更加具体。通过不同分子的表达,lincRNAs控制着许多不同的生物过程,比如某些基因的活动,当表达出现问题时,可能预示着疾病的存在。”
Hamba 和她的团队探索了 15,000 种已知 lincRNA 中的一些表达方式。他们的发现证实了早期的观察结果,即 lincRNA 表达比信使 RNA 表达更依赖于包含它们的组织。但更有趣的是,研究人员还发现,这种特异性因 lincRNA 特定部分在基因组中的来源而得到进一步增强。我们的基因组是一长串遗传信息,但通常盘绕成复杂的三维形状,称为染色体拓扑关联域或 TAD。从这些卷曲的 TAD 转录的 LincRNA 比来自这些区域之外的 lincRNA 更有可能产生组织特异性表达。
“有了在哪里寻找这些高度组织特异性 lincRNA 标记的知识,我们提出了一个分析框架来解释 lincRNA 的特性作为不同组织的指标,”Hamba 说。“作为一项实验,我们已经将我们的框架应用于心脏病肥厚性心肌病(心肌增厚),并发现了导致该疾病的蛋白质角蛋白异常表达的原因。我希望我们现在可以进一步探索这一领域,并找到一些可能导致肿瘤等疾病的潜在异常表达产物。”
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