WellcomeSangerInstitute及其合作者报告说，他们开发了肺细胞图谱，揭示了11种新的肺细胞类型，并提供了对参与抵抗肺部感染的免疫过程的新见解。

他们的发现“人类肺部的空间分辨图谱表征了腺体相关的免疫生态位”，发表在《自然遗传学》上，重点介绍了多种免疫细胞、屏障细胞及其在肺部与呼吸系统疾病和感染有关的环境。

研究人员写道：“单细胞转录组学允许前所未有地解析人肺中的细胞类型/状态，但它们的空间背景不太明确。”“为了(重新)定义肺和气道的组织结构，我们使用多组学单细胞/细胞核和空间转录组学(可在lungcellatlas.org查询)深入分析健康人肺的五个近端到远端位置。使用计算数据集成和分析，我们超越了悬浮细胞范式，发现了宏观和微观解剖组织隔室，包括上皮、血管、间质和神经束微环境中以前未注释的细胞类型。”

新的肺细胞图谱是更广泛的国际人类细胞图谱计划的一部分，它结合了单细胞测序和空间转录组学，以更全面地描述细胞如何相互作用和相互交流。

来自WellcomeSangerInstitute的研究人员和合作者对来自13名捐赠者肺组织的近200,000个细胞进行了基因分析，发现了11种新细胞类型，并显示了总共80种细胞类型的确切位置。

在新的细胞类型中，发现支气管周围成纤维细胞与COPD和特发性肺纤维化有关。

需要进一步的研究来观察这些细胞是如何参与的，但发现证明了使用肺图谱来揭示细胞通路与疾病之间新联系的潜力。

“通过能够分析同一肺部的多个位置，我们能够在一项研究中获得有关一系列细胞的关键信息，其中许多以前没有被绘制出来，”联合第一作者和博士后EloMadissoon博士解释说。WellcomeSangerInstitute和EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)研究员。

“此外，我们发现支气管周围成纤维细胞与慢性肺部疾病之间的联系表明，该图谱如何超越参考数据，并可以提供对疾病的新见解。”

研究人员还能够定义肺部微环境，他们称之为腺体相关免疫生态位(GAIN)。

“我们的研究提供了关于细胞如何在人肺和气道中进行交流的独特信息，”WellcomeSanger研究所的联合第一作者和博士后研究员AmandaOliver博士说。“通过整合单细胞和空间数据，我们能够研究上皮细胞、内皮细胞和免疫细胞如何相互作用形成免疫生态位——GAIN——这可能对预防呼吸道感染很重要。我们的单细胞数据使我们能够深入研究使这种免疫生态位发挥作用的信号回路，这可能对开发未来治疗疾病的新方法至关重要。”

该图集提供了对细胞的详细了解，并可能解释人类健康和疾病的许多方面。他们的发现可以帮助确定肺中的哪些通路或细胞可以作为目标，以帮助提高肺功能受损个体的免疫力。

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标签：细胞肺单细胞