在一项新研究中，人类生物学高级研究所(ASHBi)的研究人员报告了一种新方法，揭示了数百个参与神经分化的基因调控基序的时间调控。

该研究结果发表在《自然通讯》杂志上，由ASHBi副教授FumitakaInoue博士领导，题为“大规模并行报告扰动分析揭示神经分化过程中的时间调节结构”。

研究人员试图确定基因调控元件在细胞分化过程中协调基因表达中发挥关键作用的作用和功能。

研究人员写道：“在这里，我们在神经分化的七个早期时间点进行基于扰动的大规模并行报告分析，以系统地表征其中的调节元件和基序如何指导细胞分化。”“通过干扰活性调控区域中2000多个假定的DNA结合基序，我们描绘了四类功能元件，并观察到活性方向主要由序列本身决定，而影响的大小取决于细胞环境。”

“增强子对基因表达具有重要影响，从而决定细胞是否会生长成不同的器官。然而，尽管它们会产生后果，我们对增强子如何发挥作用却知之甚少。”Inoue解释道。

许多生化测定可用于研究增强子，但大规模并行报告基因测定(MPRA)可以一次对数千个增强子进行定量分析。

“MPRA对于研究增强子和转录因子之间的相互作用非常有用。为了从检测中提取更多信息，我们修改了检测，在转录因子结合的调控基序中引入扰动，”Inoue继续说道。

“我们将这些主题分为四组。必要的和有贡献的主题要么是激活所必需的，要么有助于激活。同样，沉默和抑制基序是抑制转录所必需的或有助于抑制转录，”井上说。

进一步观察发现，在增强或减弱的基因中，许多基因与促进神经分化或干细胞多能性有关。井上说，总的来说，这些发现证明了一个复杂的调控序列网络，它们相互作用以实现神经分化。

研究人员总结道：“总的来说，我们的结果通过直接测试数百个调节区域的基序功能，提供了神经分化早期时间点的基序功能图谱。”

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