基因组测序对全球应对的行动产生了巨大影响，随着越来越多的研究人员投入使用，该技术也得到了改进。《公共科学图书馆·生物学》上发表的一篇题​​为“迈向大流行后全球病原体基因组测序的未来”的文章指出，为了更好地应对下一次大流行，科学家们需要在这些知识的基础上发展，同时也认识到我们能力上仍然存在的差距。

北亚利桑那大学生物科学系副教授JasonSahl博士表示：“COVID-19大流行在很多方面代表了多年来测序和分析的顶峰。”“我们想强调的是，尽管人们对这一流行病的兴趣有所减弱，但其他威胁仍然存在，保持我们的势头，同时建设新的基础设施对于改善公共卫生对现有和新兴威胁的反应至关重要。”

病原体研究中的先进基因组技术

Sahl和同事副教授JasonLadner博士以及病原体与微生物研究所的同事正在致力于在病原体研究中应用和分析创新基因组技术，并研究了各种传染原，包括埃博拉病毒、寨卡病毒、鼠疫耶尔森菌。引起鼠疫)、炭疽病和类鼻疽伯克霍尔德氏菌(引起类鼻疽，一种传染性细菌性疾病)。

在他们的文章中，他们重点关注病原体的历史和基因组测序，以帮助读者了解我们现在看到的模式并不新鲜。在20世纪60年代，科学家认为随着疫苗、抗生素、个人卫生、卫生规范等的发展，传染病已经得到解决。

拉德纳和萨尔写道：“然而，我们当时并没有充分认识到人类病原体令人难以置信的多样性、它们快速进化的能力，以及病原体与其宿主之间相互作用的动态性质。”“综合起来，这些因素使我们减轻传染病影响的努力变得更加复杂。”

六十年后，病原体仍然很复杂。生物学家为各利益相关者提供了为下一次大流行做准备的路线图：强调科学家需要解决的研究缺陷;指出政策制定者迫切需要合作和投资;向公共卫生官员、媒体、慈善家和其他人解释病原体基因组测序的历史，以便他们了解病原体测序对公共卫生的全部潜力。

拉德纳指出：“我们写这篇文章是为了促进更广泛的讨论，即未来应如何使用病原体基因组测序来改善公共卫生，以及我们需要哪些类型的投资和创新来促进这一目标。”“这不再是一个小众话题，而是对多个不同领域的科学家、制定医疗保健政策的官员以及致力于了解最新进展并将其传达给公众的媒体具有广泛吸引力的话题。”

从COVID-19大流行中吸取的教训

我们需要更好的基础设施。最大的缺陷是缺乏全球基础设施来支持国家之间和不同研究机构之间的实时测序和协作。其中一些是在大流行期间建立的，但科学家们还发现了测序能力和数据共享方面的缺陷，这意味着他们正在对实地发生的情况进行不完整的了解。这需要利益相关者之间的持续投资。

我们需要扩大利用病原体基因组应对传染病的方式。这是一个科学问题，但它也比这个问题要大得多。Ladner说：“为了在未来充分发挥病原体测序的公共卫生潜力，我们需要利用COVID-19大流行产生的势头，同时确保未来投资的好处广泛适用于所有人类传染病。”。

我们需要确定病原体基因组学在应对公共卫生威胁中的作用目标。对于COVID-19，科学家们尽其所能地利用基因组，但在大多数情况下，他们对于基因组应如何为公共卫生应对做出贡献还没有明确的目标。定义这些目标将有助于研究人员规划未来的疫情爆发并评估应对措施的有效性。

我们必须保持这种势头。尽管COVID-19仍然是一种威胁，但人们对这一流行病的兴趣已经减弱。然而，抗菌素耐药性仍然是一个重大的公共卫生威胁。大流行期间建立的测序基础设施需要得到持续的联邦投资的支持，否则社会将恢复到大流行前的能力，并且将无法快速应对下一个公共卫生威胁。

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