作为一个单一的器官，我们的皮肤能够执行广泛的重要功能。皮肤病学专家呼吁提供正常人类皮肤单细胞组成的参考指南，但目前仍然缺乏。据《皮肤病学研究杂志》的一篇评论报道，建立“人类皮肤细胞图谱”的草根运动正在形成。

全球专家团队制定了一份路线图，作为针对这一重要主题创建全面、包容性参考书的第一步。

我们的皮肤发挥着重要的功能，例如保护我们免受外部威胁(病原体、紫外线)、调节体温、赋予我们触觉，并使我们能够通过颅毛和面部毛发表达自己。全身皮肤在解剖学上也存在差异，生物学家将这一特征称为“区域特异性”。

例如，我们手掌上无毛且具有复杂指纹的皮肤与头皮上有毛的皮肤截然不同。为了执行其众多功能并保持显着的区域特异性，皮肤由几种不同的细胞类型组成，而每种细胞类型又包含多种细胞状态。

利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术，研究人员可以研究组织中许多单个细胞的基因表达特征，然后通过生物信息学方法评估它们如何协同工作以执行组织功能。

加州大学欧文分校发育和细胞生物学系的共同主要作者MaksimPlikus博士解释说：“这篇综述的许多共同作者都是单细胞技术的早期采用者。这项技术需要对生物信息学方法的深入理解和对不同皮肤细胞类型保守基因表达特征的详细了解。因此，当迫切需要正常人类皮肤单细胞组成的参考指南时，该研究领域现已达到关键拐点”。

为了满足这一迫切需求，人类细胞图谱是一项国际草根努力，旨在生成每个人体器官的全面单细胞参考。

卡罗林斯卡研究所细胞与分子生物学系的共同主要作者MariaKasper博士补充道：“因为我们对人类皮肤生物学充满热情并且精通单细胞方法，所以我们将这篇综述整理为“实现生成人类皮肤细胞图谱(HSCA)目标的指南。这次审查是一种路线图，将是第一步，随后将共同努力生成实际的图谱。”

最初的图谱将基于从健康人类皮肤收集的测序细胞。作者设想，该图谱将被用作揭示保守和变化的人类皮肤细胞群以及皮肤疾病引起的分子差异的基础。

一旦完成并作为开源在线资源启动并运行，就可以利用共识图集对任何未来的scRNA-seq数据中的患者特异性变化进行半自动映射。此外，未来HSCA参考可用于支持个性化医疗，例如基于单细胞的皮肤病个性化诊断。

该评论收集了皮肤专家的知识，从基础科学家到临床医生，从实习生到经验丰富的主要研究人员。它概述了图谱的关键考虑因素，以便在五个尺度上全面表示皮肤细胞：空间、时间、性别、祖先起源和伤口反应尺度。

作为制定HSCA路线图的一部分，作者还强调了全球代表性的重要性，反映了更广泛人群的皮肤，而不是仅反映在生物医学研究中通常代表性过高的选定人群的皮肤。

他们进一步强调，为了使HSCA保持平衡，科学家需要全面考虑在单细胞数据收集和生成过程中很容易引入的无意偏差。这些偏差包括少数群体皮肤代表性不足、难以对身体部位进行采样以及不同实验室之间生成scRNA-seq数据的技术一致性。

最后，提出了一个标准化的元数据模板，用于在生成新的scRNA-seq数据集时收集详细信息。

版权说明：本站所有作品图文均由用户自行上传分享，仅供网友学习交流。若您的权利被侵害，请联系我们

标签：