金黄色葡萄球菌是一种革兰氏阳性细菌，可引起多种临床疾病。这种病原体引起的感染在社区获得性和医院获得性环境中都很常见。如果细菌进入血液，导致败血症，感染可能会危及生命。现在，PeterDoherty感染与免疫研究所领导的研究人员分析了1,300多种葡萄球菌菌株的基因图谱，并揭示了这种细菌进入血液后如此危险的原因。

该研究结果发表在《细胞报告》上的一篇题为“追踪金黄色葡萄球菌菌血症临床结果的细菌基因组预测因子的统计基因组学框架”的文章中。

研究人员写道：“严重细菌感染的结果取决于宿主、病原体和治疗之间的相互作用。”“虽然人类基因组学为影响金黄色葡萄球菌感染的宿主因素提供了见解，但人们对金黄色葡萄球菌基因型和疾病严重程度知之甚少。基于细菌病理适应是关键结果驱动因素的假设，我们开发了全基因组关联研究(GWAS)框架，以识别与金黄色葡萄球菌治疗失败和死亡率相关的适应性突变菌血症(1,358集)。我们的研究强调了万古霉素选择突变和万古霉素最低抑菌浓度(MIC)作为预测感染严重程度的关键解释变量的潜力。”

通过将这些数据与患者和抗生素信息相结合，研究人员发现，虽然患者因素对于确定死亡风险至关重要，但特定基因与抗生素耐药性以及细菌在血液中徘徊、逃避抗生素和免疫系统的能力有关。

“据我们所知，这是我们使用的全基因组关联研究(GWAS)方法首次被应用于深入研究细菌基因组、宿主因素和抗生素对细菌基因组的作用。葡萄球菌败血症的病程，”Doherty研究所的临床医生兼研究员、该论文的第一作者StefanoGiulieri博士说。

“在GWAS中，科学家扫描大量细菌的基因组，以寻找微小的变化(突变)，这些变化在具有某种特征(例如抗生素耐药性)的菌株中更常见。具有强大统计联系的突变是弄清楚细菌如何获得对患者结果重要的属性的宝贵线索。

“我们的研究揭示了对严重金葡萄球菌感染背后复杂的遗传动力学的更深入的了解。它强调了结合细菌全基因组测序、临床数据和复杂的统计基因组学来发现影响感染结果的临床相关细菌因素的潜力。”

“通过揭示金葡萄球菌抗生素耐药性的基因，我们的GWAS为科学界指明了更明确的目标，以开发治疗金葡萄球菌血液感染的有效解决方案，”微生物诊断中心主任、墨尔本大学教授BenHowden说。多尔蒂研究所(DohertyInstitute)公共卫生实验室单位(MDU)和该论文的共同高级作者。

“这些知识有可能塑造和增强我们应对这些持续感染的能力。随着细菌基因组在临床常规中的应用越来越广泛，我们越来越接近定制治疗策略，即根据感染菌株的独特基因组成定制治疗方法，而不是以同样的方式治疗每个人。”

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