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NICER是一种新颖的基因组编辑技术,其基础是通过切口酶在单条DNA链上创建多个切口。该方法可以使用两种机制纠正杂合突变:Cas9切口酶诱导的多个切口和同源染色体作为内源修复模板。研究人员认为NICER与CRISPR/Cas9一样有效,同时显着减少意外突变。
这项工作发表在《自然通讯》上,论文中,“诱导多个切口促进同源间同源重组,以纠正体细胞中的杂合突变。”
传统的CRISPR编辑使用Cas9,它会引发双链DNA的断裂。这种双链断裂是引发DNA变化的关键。然而,双链断裂的细胞修复可能导致意外突变,以及外源DNA整合到人类基因组中,这引发了CRISPR/Cas9技术临床应用的安全性担忧。
为了最大限度地减少这些意外突变,研究小组研究了Cas9切口酶的使用,它会在DNA中产生单链断裂或“切口”,通常可以修复而不会引起突变。
大阪大学生物调节和细胞反应系的AkikoTomita解释说:“使用NICER技术,可以使用未突变的同源染色体作为模板来修复杂合突变(其中一条染色体中出现突变,但同源副本中没有出现突变)”日本大学。
“虽然突变位点附近的单个切口很少导致成功的基因校正,”作者写道,“同源染色体上的额外切口通过同源间同源重组(IH-HR)极大地提高了基因校正效率。这个过程部分依赖于BRCA1和BRCA2,这表明MN诱导的IH-HR存在几种不同的途径。”
研究小组使用了基因TK1具有已知杂合突变的人类淋巴母细胞。当用切口酶处理这些细胞以诱导TK1区域的单次切割时,TK1活性以较低的速度恢复。然而,当切口酶在两条同源染色体上的该区域诱导多个切口时,通过激活细胞修复机制,基因校正效率提高了约十七倍。
大阪大学研究员ShinichiroNakada博士说:“进一步的基因组分析表明NICER技术很少诱导脱靶突变。”“我们还很高兴地发现NICER能够恢复源自涉及复合杂合突变的遗传疾病的细胞中致病基因的表达。”
由于NICER方法不涉及DNA双链断裂或外源DNA的使用,因此该方法很少引起意外的基因组改变,因此可能是传统CRISPR/Cas9方法的安全替代方案。NICER可能代表了一种治疗杂合突变引起的遗传性疾病的新方法。
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