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尽管第一个CRISPR药物Casgevy是由VertexPharmaceuticals和CRISPRTherapeutics开发的CRISPR-Cas9疗法,以前称为exa-cel,在英国被批准用于治疗镰状细胞病,但对改进基因编辑器的探索还远未结束。
为了最大限度地减少脱靶效应,武汉大学的研究人员使用“变压器”碱基编辑器(tBE)测试了一种新的基因编辑方法,以优化Casgevy用于治疗镰状细胞病和其他β-血红蛋白病(如β-地中海贫血)的相同治疗策略。tBE具有“类似保险丝”的机制,可导致编辑器在执行编辑时关闭,从而允许进行目标编辑,同时显着减少脱靶编辑。Casgevy使用tBE进行基因编辑方法,导致无法检测到的脱靶效应和携带编辑的持久造血干细胞(HSC),这证明了治疗β-血红蛋白病的安全有效的策略。
同行评审的研究文章“HBG启动子的碱基编辑诱导有效的胎儿血红蛋白表达,在人类HSC中没有可检测到的脱靶突变”发表在《CellStemCell》上。
β-血红蛋白病的tBE
血红蛋白亚基β(HBB)基因位点突变可通过抑制β-珠蛋白的产生来损害成人血红蛋白(HbA)水平,是β-血红蛋白病的常见原因。有多种基因编辑策略可用于修复β-珠蛋白生成受损。一种策略是通过恢复γ-珠蛋白表达,用造血干细胞/祖细胞(HSPC)中的胎儿血红蛋白(HbF)水平替代HbA水平,γ-珠蛋白表达在整个发育过程中受到严格调控,并在出生后不久被与其启动子结合的阻遏物所抑制。区域,达到治疗水平。
BCL11转录因子A(BCL11A)和含有锌指和BTB结构域的7A(ZBTB7A)是γ-珠蛋白基因表达的两个主要抑制因子,负责其沉默。突变这些位于HBG基因座调节区的结合基序是重新激活γ-珠蛋白表达的一种方法。Casgevy通过应用Cas9核酸酶干扰HSPC中的阻遏蛋白结合基序来实现这一点,该基序依赖于产生双链断裂,从而在HSPC中带来DNA损伤反应和细胞毒性的风险。
胞嘧啶或腺嘌呤碱基编辑器(CBE或ABE)可以将C碱基更改为T或A碱基更改为G碱基更改,而不生成DSB。先前的研究使用针对调节基序的碱基编辑器成功诱导了γ-珠蛋白表达。然而,在分析脱靶事件时,CBE和ABE都引发了高脱靶活动,引发了强烈的安全担忧。
武汉大学的研究人员直接将HSPC中用于HbF诱导的tBE编辑与使用Cas9核酸酶或常规碱基编辑器(例如hA3A-BE3、BE4max、CE1048-1063-CBE和A3A(N57Q)-BE3)的其他临床或临床前编辑策略进行比较。为了将tBE递送至细胞,研究人员选择了使用等渗溶液的mRNA递送方法,而不是电穿孔,因为电穿孔会影响递送效率和细胞健康。与其他方法相比,tBE修饰的BCL11A结合基序诱导了比其他方法更高的HbF水平,并且编辑在重新填充的干细胞中持续存在。体外和细胞结合测定表明,tBE生成的TGATTA基序完全消除了其与BCL11A的相互作用。DNA和RNA谱在tBE编辑的细胞中没有检测到脱靶突变。
这项研究表明,对HBG1/2启动子内的BCL11A结合位点进行基于tBE的编辑是在人类HSC中再次打开HbF的强大且非常有效的方法。它还表明,可以递送几乎没有脱靶活性的mRNA,这是推进自体HSC中tBE临床开发的强有力理由,作为治疗β-血红蛋白病的可能方法。
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